En 2020, ante las recomendaciones que se realizaron en materia de salud pública debido a la emergencia sanitaria generada por el virus SARS-CoV-2 (COVID-19), el Museo Amparo tomó la decisión de cerrar sus instalaciones temporalmente. Como parte del compromiso con la comunidad, se ofreció un programa de actividades gratuitas en línea para todo público a través del sitio web y las redes sociales.