Con motivo del décimo aniversario del Museo Amparo, en 2001 se inauguró la exposición Rodin en México. La muestra, realizada con el apoyo del Museo Soumaya, incluyó 28 esculturas del artista francés Auguste Rodin, hechas en mármol y bronce, entre las que destacaron El Pensador y Puertas del Infierno.

En 2001, en el marco de las celebraciones del aniversario del Museo, se llevó a cabo la inauguración de la exposición Propuestas cardinales como preludio del siglo XXI. En la muestra pictórica participaron 25 artistas que representaron lo más destacado del arte contemporáneo mexicano, entre los que figuraron Magali Lara, Alejandro Colunga, Julio Galán y Sylvia Ordoñez.

En 2001, el Ayuntamiento de Puebla entregó el premio al Mérito Civil a la señora Ángeles Espinosa Yglesias Rugarcía por su actividad filantrópica y generosidad en beneficio del estado de Puebla. Durante la sesión se destacó el apoyo que brindó la Fundación Amparo para la reconstrucción de templos afectados por el sismo y las lluvias.

En 2001, como parte de los eventos organizados en torno a la exposición El violín Stradivarius en Puebla (El Cremonés 1715), se realizó un concierto en el Auditorio de la Reforma. La presentación estuvo a cargo del violinista ruso Sergej Krylov, quien interpretó melodías clásicas con el Cremonés 1715 acompañado de Stefania Mormone en el piano.

En el verano de 2001, el Museo Amparo, junto con otras 14 instituciones culturales de Puebla, fue parte del rally de museos Imaginarte: ¡hay un museo cerca de ti!, programa que permitió a los niños visitar de forma gratuita los diferentes centros culturales participantes. A través de un cuadernillo editado por el CONACULTA, los asistentes aprendieron sobre el arte y la cultura de los distintos acervos históricos y artísticos de Puebla. 

En 2001, el historiador Enrique Florescano inauguró la exposición Lord Kingsborough. Antigüedades de México: Códices, dibujos y crónicas del México antiguo. Integrada por 9 volúmenes en los que se reproducen 15 códices mexicanos, dibujos y crónicas históricas sobre las culturas prehispánicas y poshispánicas, Antigüedades de México es una de las obras bibliográficas más importantes realizadas en el siglo XIX.

Con motivo de la exposición temporal Lord Kingsborough. Antigüedades de México: Códices, dibujos y crónicas del México antiguo, en 2001 se editó un disco compacto interactivo (CD-I). En este material, de 475 fotografías digitalizadas con música original de Jorge Reyes, se podían consultar la vida y obra de Lord Kingsborough, así como información de 10 códices mesoamericanos.